Pretende-se que os alunos conheçam as principais técnicas utilizadas em separação, análise e identificação de proteínas obtidas de amostras complexas e num contexto de saúde. Deseja-se que conheçam os principais desafios que se colocam a nível de proteómica na área da saúde e reconheçam a importância desta abordagem.
1. Importância da proteómica no contexto Saúde
Abordagem de proteómica funcional; Identificar marcadores de doenças; Identificação de patologias através de uma análise proteómica quantitativa;
2. Desafios à proteómica no contexto Saúde
Identificação de proteínas num complexo biológico; Dificuldades na deteção de proteínas minoritárias;
Conjugação de técnicas de separação e purificação;
3. Técnicas de separação e deteção
Preparação e manipulação da amostra; Separação cromatográfica (HPLC, FPLC); Separação electroforética (SDSPAGE, nativa bidimensional, 2DE-SDS-PAGE); Coloração (coomassie, coomassie coloidal, prata, fluorescência, imuno);
4. Técnicas de análise de proteínas
Análise de imagem (ImageMaster 2D, Quantity one)
5. Técnicas de identificação de proteínas
Sequenciação de Edman N-terminal; Espectrometria de massa (MALDI-TOF, MALDI-TOF-TOF, ESI-MS-MS)
6. Análise in sillico
Bases de dados (NCBI, Swiss Prot, MSDB, MEROPS); Ferramentas de análise molécular.
Pretende-se que as aulas sejam compostas por uma parte expositiva de alguns aspetos teóricos fundamentais, que permitam lançar questões, incentivando os alunos a uma participação ativa em que se pretende correlacionar os temas abordados. Numa segunda parte serão dados problemas práticos para os alunos resolverem. Será indicada bibliografia, onde os alunos poderão consolidar os temas abordados e aprofundar aspetos relacionados. Serão fornecidas ferramentas WEB open-source para que os alunos resolvam problemas e obtenham informação de forma autónoma e racional.
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http://www.ionsource.com
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